Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms