Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAVP06756 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAVP06756 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAVP06756 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAVP06756 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAVP06756 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAVP06756 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAVP06756 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAVP06756 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGAVP06756 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAVP06756 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGAVP06756 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ITGAVP06756 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ITGAVP06756 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ITGAVP06756 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ITGAVP06756 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ITGAVP06756 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ITGAVP06756 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ITGAVP06756 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ITGAVP06756 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ITGAVP06756 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ITGAVP06756 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms