Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PPFIA3O75145 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms