Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms