Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF208O43345 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF208O43345 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms