Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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