Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
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BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
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BIVM-ERCC5R4GMW8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
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BIVM-ERCC5R4GMW8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
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BIVM-ERCC5R4GMW8 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
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BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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