Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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