Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDP2Q9P2J9 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDP2Q9P2J9 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDP2Q9P2J9 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDP2Q9P2J9 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDP2Q9P2J9 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDP2Q9P2J9 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDP2Q9P2J9 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDP2Q9P2J9 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDP2Q9P2J9 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDP2Q9P2J9 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDP2Q9P2J9 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDP2Q9P2J9 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDP2Q9P2J9 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDP2Q9P2J9 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDP2Q9P2J9 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDP2Q9P2J9 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDP2Q9P2J9 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDP2Q9P2J9 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms