Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms