Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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