Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CNIH4Q9P003 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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