Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms