Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms