Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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