Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms