Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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C9orf16Q9BUW7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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C9orf16Q9BUW7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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C9orf16Q9BUW7 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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