Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHOXF2Q9BQY4 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHOXF2Q9BQY4 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHOXF2Q9BQY4 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHOXF2Q9BQY4 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHOXF2Q9BQY4 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHOXF2Q9BQY4 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHOXF2Q9BQY4 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHOXF2Q9BQY4 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms