Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 IFNAR2-201ENST00000342101 2606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 RN7SL479P-201ENST00000472003 300 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 MYCBP-203ENST00000494695 750 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 AL139317.2-201ENST00000556998 158 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 FAM86FP-201ENST00000338711 969 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 MB-204ENST00000401702 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 AC004923.1-201ENST00000527543 776 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT140Q96RY7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms