Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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