Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCMH1Q96GD3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms