Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERCC4Q92889 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms