Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCDC80Q76M96 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCDC80Q76M96 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCDC80Q76M96 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCDC80Q76M96 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCDC80Q76M96 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCDC80Q76M96 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCDC80Q76M96 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCDC80Q76M96 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCDC80Q76M96 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCDC80Q76M96 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCDC80Q76M96 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CCDC80Q76M96 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC80Q76M96 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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