Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBR1LQ6UX01 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms