Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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SP6Q3SY56 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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SP6Q3SY56 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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SP6Q3SY56 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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