Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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