Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms