Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 ROBO2-209ENST00000487694 5919 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MTUS2-206ENST00000612955 7430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 RPS6KA2-211ENST00000510118 5992 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms