Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC092634.5-206ENST00000593670 812 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 PDLIM1P1-201ENST00000604187 969 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC004771.1-201ENST00000438266 583 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC005920.4-201ENST00000573301 492 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
R3HDM1Q15032 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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