Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms