Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMC1AQ14683 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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