Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CUL3Q13618 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CUL3Q13618 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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CUL3Q13618 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CUL3Q13618 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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