Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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MTMR3Q13615 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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MTMR3Q13615 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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MTMR3Q13615 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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MTMR3Q13615 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms