Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TOP3AQ13472 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TOP3AQ13472 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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TOP3AQ13472 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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TOP3AQ13472 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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