Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 254.4 ms