Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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DUSP4Q13115 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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