Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FOXI1Q12951 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms