Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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FOXF2Q12947 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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FOXF2Q12947 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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FOXF2Q12947 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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FOXF2Q12947 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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FOXF2Q12947 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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FOXF2Q12947 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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