Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms