Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC073551.1-201ENST00000450741 834 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC074386.1-206ENST00000487102 761 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC117498.1-201ENST00000548742 713 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 OR4M2-201ENST00000614722 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC007204.1-201ENST00000621794 555 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 OR52E4-201ENST00000316987 1027 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 SH2D1A-201ENST00000360027 593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 RPL7P7-201ENST00000428803 703 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC069277.1-201ENST00000433639 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 PPP1R2P2-201ENST00000440405 613 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC006355.1-201ENST00000440982 1012 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 SERBP1P6-201ENST00000507707 932 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC239868.3-201ENST00000577853 1234 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AP006587.6-201ENST00000582128 1091 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms