Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42EP1Q00587 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42EP1Q00587 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42EP1Q00587 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CDC42EP1Q00587 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CDC42EP1Q00587 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms