Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms