Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ELLP55199 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ELLP55199 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ELLP55199 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ELLP55199 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ELLP55199 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ELLP55199 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ELLP55199 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ELLP55199 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ELLP55199 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ELLP55199 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ELLP55199 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ELLP55199 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ELLP55199 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ELLP55199 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ELLP55199 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ELLP55199 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ELLP55199 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ELLP55199 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ELLP55199 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ELLP55199 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ELLP55199 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ELLP55199 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ELLP55199 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ELLP55199 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ELLP55199 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ELLP55199 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ELLP55199 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ELLP55199 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ELLP55199 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ELLP55199 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ELLP55199 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ELLP55199 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ELLP55199 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ELLP55199 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ELLP55199 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.5 ms