Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms