Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms