Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC11A1P49279 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms