Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms