Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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