Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARID4AP29374 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms