Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms